将税警总团的兵权从宋子文手中夺走，掌控了整个税警总团。

孙立人又不是黄埔系出身，他是清华毕业之后，到美国弗吉尼亚军事学院深造，税警总团也走的是美军的路子，和蒋介石当时走德军路子格格不入，所以孙立人并不是蒋介石的嫡系。

而淞沪会战之后，税警总团被迫南撤，整个税警总团出现分裂，蒋介石试图将税警总团并入军统体系。

孙立人不愿意让麾下的税警团进入军统体系，于是便请命改编，要求赴缅作战，这才使得蒋介石将他们税警团改编成为了新三十八师，归入第六十六军，属于较早进入缅甸作战的部队。

曼德勒会战计划破产之后，蒋介石看到远征军已经彻底失败，而第五军和新三十八师都是他手中的王牌部队，因为和史迪威之间的矛盾，不愿意让这些部队落入到史迪威的控制，于是遥控指挥命令所有远征军撤回国内。

第五军军长杜聿明可是蒋介石的嫡系，所以忠实执行了蒋介石的命令，拒绝了史迪威让他们撤往印度的提议，毅然决然的率领第五军主力北撤，进入到了野人山之中，最终也导致了第五军主力几乎彻底断送在了野人山之中。

但是孙立人预料到了向北撤退已经不现实，这么多部队进入野人山将会是一场巨大的灾难，于是听从了史迪威和英军方面的建议，最终没有听从蒋介石的命令，悍然抗令不尊，率领新三十八师撤往了英帕尔，这才将新三十八师全建制保全了下来，成为了在第一次远征军入缅作战失利之后，唯一一支整建制保全下来的中队。

而孙立人这么做冒了极大的风险，仅仅是抗命这一条，就够杀头了，所以孙立人承受了极大的压力。

现在蒋介石得知孙立人把新三十八师带到了印度，当然十分生气，但是因为新三十八师并非他的嫡系，这个师主要军官士兵，都是出自税警总团，加上还有史迪威代表的美国方面施压，另外还从抗战大局出发，所以他也不敢擅动孙立人。